樱跑去间桐家去找脏砚，要了结一切，如果杀不了脏砚，就自杀，并让rider留在自己房间之中，伪装成自己。
  可是虫爷对樱的一举一动了如指掌，并做了狡猾的安排：樱在间桐家遇到了渣二。
  渣二意图强x了樱，并且由于对卫宫和凛的嫉妒，不停从言语上侮辱樱，樱的肉体和精神也遭受着刻印虫和黑影的折磨，最终在虫爷的诱导下，樱彻底黑化了！
  樱杀死了渣二。
  “什么啊，只有这点能耐吗？并没有我想象中那么强嘛，姐姐。”
  急忙跑回家中的卫宫，发现樱已经黑化，并且闯进家中要带走伊莉雅作为召唤圣杯的祭品。凛出面阻止，却被樱吸取了魔力。
  樱冷漠的话语跟此前那温柔的樱恍若两人，她的身上爬满了散发这邪恶污秽气息的血色纹路。
  樱想要杀掉凛，卫宫阻拦，黑化的樱竟然想要对卫宫出手！
  那是她曾经唯一所喜欢的人，是带给她温暖的人。
  如今竟然毫不犹豫的对卫宫出手。
  但是，曾经还未黑化时，她对rider用了最后一个令咒：保护卫宫。
  正是那一个令咒，rider从黑樱的手下救下了卫宫。
  倘若真的杀掉了自己唯一的亲人与唯一的爱人，那么她将永堕黑暗，再也无法回头。但是，她用自己最后的一个令咒，将在那黑暗的狂风中微弱、渺小仿佛随时都要熄灭的光明守护住了。
  伊莉雅挺身而出，自愿跟黑樱离开，让樱放过了其他人，并且将樱带去了她的城堡。
  一直以来都是作为幕后大boss登场的绮礼，在这里竟然提出了跟卫宫联手，两人趁着黑樱正处于被侵蚀的痛苦之际，救出了伊莉雅。
  虫爷跟真assassin追来，绮礼断后，让卫宫跟伊莉雅先跑。
  绮礼展现出了非人类的实力，跟英灵真assassin和虫爷一起战斗竟也不落下风，利用自己的身体优势（心脏被黑泥填充而活着），故意给真assassin露了一个破绽，引诱他使用出对自己完全无效的妄想心音，然后趁机杀掉了虫爷的肉体。
  成功将伊莉雅救出来后，伊莉雅讲述了安哥拉?曼纽来龙去脉和圣杯的真相。
  黑樱的幻影出现，通知卫宫和远坂凛赶快逃跑，因为她自己不知道什么时候就会迷失本性。而远坂凛却明确告诉樱，自己一定会去杀了她。
  樱凄惨地笑着消失了。
  卫宫、伊莉雅、凛三人为最后的战斗制作出了宝石剑。
  虫爷肉体被杀，但是却还没有彻底死去，他的本体还潜藏在樱的体内，意图夺取樱的肉体，但是却没想到黑樱已经完全脱离了她的控制。
  黑樱将折磨了自己无数年的虫爷的本体——一个恶心而丑陋的虫子终于从寄宿在自己心脏上揪了出来，像踩死蟑螂一般杀掉。
  脸上绽放出来的笑容，已经彻底失去了曾经的温暖，让人感到一股寒意。
  最后的大战柳洞寺下，卫宫和rider、凛遇到了黑化saber，saber按照樱的要求让凛通过，却挡住了rider和卫宫。
  黑化的saber拥有近乎无限的魔力，曾经当大招来用的誓约炮，可以当肆意挥舞，黑色的洪流宛如灭世之光。
  但是在这里，一直以来都是酱油的rider，终于全面爆发，发挥出了自己应有的实力，摘去了眼罩，露出了她的魔眼。
  美杜莎有着即使在魔眼之中也是相当于最高等级的石化魔眼“cybele”。美杜莎拥有的石化魔眼，被认为不可能以魔术再现。
  正如传说那样，被美杜莎的魔眼捕捉到者，对魔力在c级以下时就会无条件石化。b级者则须受到豁免检定来判定是否被石化。虽然无法石化a级者，但会带给对方“重压”的效果，使全能力下降一个等级。
  rider竟然跟黑saber打的难解难分，卫宫也投影螺旋箭，攻击黑saber。
  两人同时开大，使用宝具对轰，眼看rider不敌，卫宫投影炽天覆七重圆环帮rider挡住了saber的攻击，rider占据上风，击败黑saber。
  而卫宫趁着黑saber无法行动之际，上前亲手杀死了saber……
  过往的一幕幕在脑海中闪过，跟saber的相遇，跟saber的并肩战斗。卫宫跟saber对视着，saber没有抵抗，他挥下了手臂，将剑刺进了saber的胸口。
  那一剑的惆怅，仿佛戳在了观众们的心上，很痛，很难受，实在不是滋味。但是这就是卫宫自己选择的道路，注定只能由他来背负。
  另一边，本应该是两个姐妹的凛和樱，也战斗在了一起。
  一个是吞噬了无数英灵，第三法的半成品，魔力几乎无限的黑圣杯——樱。
  一个是第二法的复制品，可以吸取无数个平行空间魔力的宝石剑——凛。
  两人打的难解难分，每一次挥手，几乎就是毁天灭地的魔流，哪怕是英灵在这里，怕也不敌两人中的任何一个。
  仅就程度来说，双方都不是完整的五大魔法，但却几乎接近第二魔法和第三魔法，因此实力应该说是平手，但凛更有战斗经验，肉搏技能师从武术大师绮礼，身为“普通人”的樱完全不是对手。
  她将宝石剑向樱扔去，这个足以让引发无数人争夺的奇迹之剑像一个破球一样扔掉，然后引爆，巨大的光芒让樱无法移动，凛向樱冲去。
  “就要死了吗？”
  樱想着，或许死亡也好呢。
  凛从没有在樱的面前表现过亲密的态度，甚至可以说一直以来都表现的是身为魔术师冷酷的一面。
  当知道樱也是一个master之后，她就将樱视为圣杯战争的敌人。
  当知道樱会发狂，很危险的时候，一度说着要杀掉樱。
  当樱残存的意志向她通风报信，希望他们快点离开的时候，凛也冷冷的说一定要杀掉她！
  可是，当这一切摆在他的面前，当她真正能够杀掉黑樱的时候，她却没有下手。
  任何疼痛都没有降临，她反而感受到了一个温暖触感，那个触感是人类的血液，却不是她的，而是从姐姐被划伤的腹部流出。
  血液汩汩流出，即使快要倒下，却也依然坚定、紧紧的抱着樱。
  “……我真是笨蛋啊。”凛轻柔地说着。
  模糊不清的声音，那是樱一直憧憬的，虽然总喜欢讽刺，不留情面，可是却又温暖、柔和，她的姐姐远坂凛的声音。
  从刚刚来到这里的时候，凛就发现，不论她嘴上如何说，可是手下却果然无法对樱下手啊。
  “我一直很喜欢樱，我不但想要一直看着你，也希望你能够总是面带笑容……嗯，我一直相信着，只要我过的越加辛苦，你就能够快乐。所以……我没有半点能够想到痛苦的闲暇。”
  自从樱被送走后，这是姐妹多年来第一次神情相拥。
  “姐……姐姐……”樱呆呆的呼唤着。
  凛的体温渐渐消失，却不曾有过一句怨言，不曾有过一个后悔，不曾皱过一次眉头。
  不对，要说后悔，她也有过，她从不知道樱竟然有着那样残忍的遭遇，她所后悔的不是自己的死亡，而是无法拯救自己最爱的妹妹这一件事。
  “对不起，原谅我这个任性的姐姐……还有，谢谢，那个缎带，你能一直系着，我好高兴。”
  那是凛送给妹妹的礼物，也是让樱一直坚持着的礼物。
  因为她知道自己有个姐姐，远坂凛。
  温暖只有那短暂的一刻，像随风飘散的红花一样，跌落在祭坛上，仿佛海市蜃楼，只一瞬间就消失了。
  樱看着自己的手。
  是哪里出错了吗？
  她那么渴望着的东西，其实都近在眼前。
  她，却用自己的双手，亲手将自己渴望得到的幸福打碎……
  “啊啊——”
  樱陷入了深深的自责，黑色的影子和令咒束缚着樱，樱抗拒着，被凛重新拉回光明的她，想要杀掉自己，但是她连自杀都做不动了。
  对于黑影来说，樱是必要的本体。
  卫宫告诉她，远坂还没有死，又给陷入了自责与自我诅咒、自我放弃的樱注入了希望。
  卫宫随后投影出破除契约的短剑，斩断了樱与黑圣杯的联系。
  由于来自红a手臂的反噬，他的身体已经由内而外被钢铁剑刃刺穿。
  卫宫为了保护樱，独自用尽了最后的魔力投影了saber的誓约胜利之剑exculibur，最后凭着残存的意志硬生生的破坏了圣杯。到死亡的时候，卫宫也保持着站立的姿势。
  越好了。
  当冬天过去，春天来临之际——
  樱从噩梦中醒来，以为自己黑化后所做的一切只是噩梦，醒来后学长还在身边。但是找遍整个屋子却找不到心爱的学长了，才知道一切不是噩梦。拒绝了姐姐远坂凛住在一起的邀请，买下了卫宫士郎的房子，种上花草，在每一个鲜花盛开的春天等待卫宫士郎的回来。
  春天来临……
  春天来临……
  春天来临……
  春天来临……
  春天来临……
  春天来临……
  所等待之人，还没有回来。
  如果还不回来，她就要成为一个老太婆了。樱如此想着。
  然后，春天又再度来临。
  岁月如梭，年迈樱闭上眼睛，再张开。
  身体忽然变得轻灵，仿佛又恢复了少女的活力。
  山丘上开满了一整片的樱花，从那令人怀念的山坡上，一如往昔不变的身影，少年挥舞着手臂——